Кәсіпорынның негізгі мақсаты аурулардың тірі кезіндегі диагностикасын жақсарту, өлім себептерін нақтылау, өлім себептерінің мемлекеттік статистикасының шынайы деректерін қамтамасыз ету арқылы халыққа емдеу-профилактикалық көмек көрсетуді одан әрі жетілдіру, емдеуші дәрігерлердің біліктілігін арттыру және диагностика мен емдеу ақаулықтарын талдауды жүзеге асыру болып табылады